1. Bingkai Segilima garis hitam tebal berarti kuatnya pengalmn sila-sila Pancasila
2. Warna dasar biru mempunyai arti warna identitas SMP warna laut melambangkan luasnya ilmu pengetahuan.
3. Tulisan SMPN 3 Pleret berarti identitas sekolah
4. Bintang segilima warna keemasan berarti ketaqwaan dan keimanan kepada Tuhan Maha Esa
5. Pena berarti sarana untuk menuntut Ilmu
6. Bola Pengembangan bidang olah raga
7. Dua sayap berarti mengembangkan potensi yang ada
8. Buku berarti sumber ilmu pengetahuan
9. Pita bertuliskan Bantul Mengharumkan dan menjunjung tinggi kearifan Bantul
10. Sembilan unsur lambang berarti menuju kesempurnaan
VISI:
‘TAKTIS BERKARYA (TAQWA, KREATIF, KREATIF, BERPRESTASI, BERKARAKTER DAN BERBUDAYA)
Indikator Visi Sekolah:
1. Terwujud peningkatan Iman dan Taqwa
2. Menumbuhkan semangat menghasilkan karya dan ketrampilan siswa
3. Tercapai peningkatan perolehan Nilai Ujian
4. Tercapai peningkatan prestasi Akademik
5. Tercapai peningkatan prestasi dalam bidang olah raga, seni dan sains
6. Terwujud peningkatan ketrampilan informasi Teknologi dan Komunikasi
7. Terwujud warga sekolah yang berkarakter Indonesia
8. Terwujud pelestarian lingkungan sekolah yang bersih dan sehat
MISI
Misi yang dikembangkan dari Visi di atas meliputi:
1. Meningkatkan keimanan dan ketaqawaaan kepada Tuhan Yang Maha Esa sluruh warga
2. Meningkatkan ketrampilan siswa untuk menghasilkan karya
3. Meningkatkan perolehan Nilai Ujian
4. Melaksanakan proses belajar mengajar secara efektif dan efisien
5. Melaksanakan penembangan diri di bidang olahraga, senibudaya, sains sehingga berprestasi
6. Membekali ketrampilan Informasi Tehnologi dan komunukasi di era global
7. Mewujudkan sumber daya manusia yang berkarakter melalui kegiatan pembiasaan
8. Melaksanakan kegiatan 10 K (kebersihan, Keindahan, Kerindangan, Ketertiban, Kenyaman, Kesehatan, Kekeluargaan, Keamanan, Keterbukaan, Keteladanan)
